一、破坏细胞结构
1.细胞壁损伤：抗菌物质可以竞争性抑制合成细胞壁成分的酶反应，从而抑制微生物细胞壁的合成。(青霉素、头孢菌素、季铵盐、溶菌酶切断葡聚糖、醛与氨基的反应)
2.破坏细胞膜：破坏细胞膜中脂质分子与蛋白质的连接，破坏磷脂的分子结构；通过改变细胞膜的表面电荷性质，破坏细胞膜的通透性；通过抑制磷脂各种成分的合成，抑制细胞膜的合成。
3.破坏蛋白质结构：抗菌物质可使酶变性失活，与蛋白质的巯基、氨基相互作用，破坏酶蛋白的立体构象，甚至分解一部分蛋白质，从而破坏蛋白质链间的亲油键。
二、影响新陈代谢
1.破坏酶的三维构型，从而使酶变性失活：当防霉物质破坏酶蛋白的空间构型时，势必会使其活性中心断裂，使酶失去活性；
2.抑制酶活性：防霉剂可与酶-SH、 -OH等活性中心氨基酸残基的活性基团相互作用。使这些活性基团的化学性质和空间构型发生改变，但酶活性降低甚至丧失；
3.与酶的活化剂(金属离子)螯合，抑制酶的活性：防霉物质可干扰细胞内金属的利用，从而抑制酶的活性，在一定空间内结合金属，阻止微生物利用；它还可以进入微生物细胞，并结合细胞中的金属。
